马 飞教授
马 飞 男，汉族，1968年6月生，博士，教授，博士生导师。主要从事比较基因组学与生物信息学研究。2001年7 月毕业于南京农业大学，获农业昆虫与害虫防治专业博士学位。2001年9月至2003年8月，清华大学生物信息研究所博士后。现为南京师范大学生命科学学院教授。兼任江苏省动物学会理事，江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会成员，美国遗传学会会员。
人物履历
1986年9月至1990年7月，安徽农学院学习，获学士学位，导师邹运鼎教授；
1990年7月至1998年8月，安徽省白湖农科所，助理农艺师、农艺师；
1998年9月至2001年7月，南京农业大学学习，获博士学位，导师程遐年教授；
2001年9月至2003年8月，清华大学生物信息研究所博士后, 合作导师李衍达院士；
2003年9月至2004年7月，厦门大学生命科学学院副教授；
2004年8月至2008年8月，辽宁师范大学生命科学学院特聘教授；
2008年8月至今，南京师范大学生命科学学院特聘教授；
曾获荣誉
2000年“几种作物（树木）植株成分与昆虫生长发育的关系”获安徽省自然科学奖三等奖（第5完成人）。
2006年入选辽宁省优秀人才支持计划。
2006年入选辽宁省高等学校优秀青年骨干教师。
2007年入选教育部新世纪优秀人才支持计划。
2007年“进化生物学，第八届教育软件大赛”，高等教育组三等奖，辽宁省教育厅，排序2。
2008年“七鳃鳗药用蛋白生物学活性研究”，辽宁省科技进步三等奖，排序 4。
2010年度入选南京师范大学“青蓝工程”中青年学术带头人。
2011年度荣获南京师范大学“优秀教师奖”。
研究方向
1. microRNA的进化与功能研究
采用分子生物学、比较基因组学以及生物信息学的理论与技术开展microRNA基因家族的分子进化研究。重点开展microRNA在文昌鱼以及昆虫免疫中的功能和作用机制研究，以及开展microRNA介导的癌症调控网路及其作用机制研究。
2. 比较基因组学（Comparative Genomics）
比较基因组学是通过对系统发育进化中重要物种基因和基因家族的比较分析，揭示基因、基因家族的起源和功能及其在进化过程中复杂化和多样化产生的机制。开展基因和基因家族的进化、结构与功能的关系以及人类疾病基因识别与功能等方面的研究，目的是了解所有基因和基因家族在基因组中的分布以及在演化进程中所产生的变化及其遵循的规律。
3. 生物信息学（Bioinfomatics）
主要涉及生物信息数据库及软件开发、生物信息知识发现与数据挖掘、以及microRNA介导的基因调控网络研究。
主要成就
已主持国家自然科学基金、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、863计划专题、973计划子课题以及国家转基因生物新品种培育重大科技专项子课题10余项。在Molecular Biology and Evolution, Bioinformatics, BMC Evolutionary Biology, FEBS Letters, Developmental & Comparative Immunology, Fish & Shellfish Immunology, Mutation Research等国际重要学术刊物上发表SCI收录论文30余篇。参编学术著作和教材三部。获省部级自然科学和科技进步奖各一项。已申请国家发明专利1项。
主要科研项目
1. 江苏省高校自然科学研究重大项目(No.12KJA180005): 文昌鱼免疫相关microRNA识别、进化与初步的功能研究, 2012—2015。
2. 教育部博士点联合基金项目(No.20113207110009): 靶向调控文昌鱼免疫相关基因的microRNA筛选、鉴定及功能分析, 2012—2014.
3. 教育部新世纪优秀人才支持计划项目（No. NCET-07-0405）：文昌鱼microRNA基因及其靶标的识别与比较基因组研究，2008—2010。
4. 国家自然科学基金（No. 30970348）：脊椎动物miRNA基因的起源与进化分析， 2010—2012。
5. 国家转基因生物新品种培育科技重大专项子课题项目（2009ZX009-063B）：抗寒/抗旱相关基因的生物信息学分析及功能验证，2009—2010。
6. 国家重点基础研究发展计划（973计划）子课题 （No. 2010CB126206）：稻田生态系统对稻飞虱种群数量调控功能及机制， 2010—2014 (参加)。
7. 国家自然科学基金（No. 60575005）：可变剪接基因的模式识别与克隆验证，2006—2008。
8. 国家自然科学基金（青年基金）（No.60305001）：真核生物选择性剪接基因起源与进化的生物信息学研究，2004—2006。
9. 国家高技术研究发展计划（No. 2007AA09Z428）：七鳃鳗药用相关基因的筛选、鉴定与功能研究，2008—2010（副组长）。
10. 教育部科学技术研究重点项目（No.206032）：日本七鳃鳗药用相关基因的筛选、克隆表达与基因工程制药，2007—2009。
出版的著作
1. 李庆伟，马飞编著，《鸟类分子进化与分子系统学》。 科学出版社，2007年8月。
2. 程遐年，吴进才，马飞编著，《褐飞虱的研究与防治》。 中国农业出版社，2003年9月（本书获2002年国家科学技术学术著作出版基金的专项出版资助，并作为该社重点学术著作出版）。
3. 肖浪涛主编，马飞参编， 十一五《生物信息学》教材。 中国农业出版社，2006年10月。
主要论文
1. Qin S, Jin P, Zhou X, Chen L, Ma F*. Divergences on microRNA target sites between repetitive and non-repetitive sequences in 3'-UTRs in Drosophila melanogaster. BMC Genomics, 2013, accepted.
2. Song X, Hu J, Jin P, Chen L, Ma F*. Identification and evolution of an NFAT gene involving Branchiostoma belcheri innate im-munity. Genomics, 2013, accepted.
3. Jin P, Gao Y, Chen L, Ma F*. Cloning and characterization of a COMMD4 gene from amphioxus (Branchiostoma belcheri): An insight into the function and evolution of COMMD4. Immunology Letters, 2012, 148(2):110-6, 2012.
4. Jin P, Zhou L, Song X, Qian J, Chen L, Ma F*. Particularity and universality of a putative Gram-negative bacteria-binding protein (GNBP) gene from Amphioxus (Branchiostoma belcheri): insights into the function and evolution of GNBP. Fish and Shellfish Immunology, 2012,33:835-845.
5. Jin P, Hu J, Qian J, Chen L, Xu X, Ma F*. Genomic characterization, phylogeny and expression analysis of a putative lipopolysaccharide-induced TNF-α factor (LITAF) gene homologue from Amphioxus (Branchiostoma belcheri). Fish and Shellfish Immunology, 2012，32:1223-1228.
6. Zhou X, Jin P, Qin S, Chen L, Ma F*. Systematic investigation of Amphioxus (Branchiostoma floridae) microRNAs. Gene, 2012, 508 :110–116.
7. Zhou Lu，Jin Ping，Qian Jinjun，Chen Liming，Ma F*. Molecular cloning and characterization of an IKK homologue from amphioxus (Branchiostoma belcheri). Mol Biol Rep，2012，39:10751–10758.
8. Song X, Jin P, Hu J, Chen L, Li-Ling J, Ma F*. Involvement of AmphiRel, a Rel-like gene identified in Chinese amphioxus (Brachiastoma belcheri), in LPS-induced defense response: implication for evolution of Rel subfamily genes. Genomics, 2012，99:361-369.
9. Song X, Jin P, Qin S, Chen L, Ma F*. The evolution and origin of animal Toll-like receptor signaling pathway revealed by network-level molecular evolutionary analyses. PLoS ONE, 2012, 7(12): e51657.
10. Jin P, Cai R, Li-Ling J, Ma F*. Features of missense/nonsense mutations in exonic splicing enhancer sequences from cancer-related human genes. Mutation Research-Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 2012, 740:6-12.
11. Jin P, Qin S, Chen X, Song Y, Li-Ling J, Xu X, Ma F*, Evolutionary rate of human tissue-specific genes are related with transposable element insertions, Genetica, 140(10-12):513-23, 2012.
12. Jin P, Ji X, Wang H, Li-Ling J, Ma F*. AmphiEST: enabling comparative analysis of ESTs from five developmental stages of Amphioxus. Marine Genomics, 2010, 3:151-155.
13. Song S, Guo J, Li-Ling J, Huang Q, Chen X, Ma F*. Comparative component analysis of exons with different splicing frequencies. PLoS ONE, 2009, 4(4): e5387.
14. Ma X, Huang Q, Li-Ling J, Hou L, Ma F*. Systematic analysis of alternative promoters correlated with alternative splicing in human genes. Genomics, 2009, 93: 420-425.
15. Liu X, Li-Ling J, Hou L，Li Q , Ma F*. Identification and characterization of a chitinase-coding gene from Lampetra japonica with possible roles in gonadal development and innate immunity. Developmental and Comparative Immunology, 2009, 33（2）：257-263.
16. Huang Q, Guo J, Ge Q, Li-Ling J, Chen X, Ma F*. Comparative analysis of distinct noncoding characteristics potentially contributing to the divergence of human tissue-specific genes. Genetica, 2009, 136(1):127-134.
17. Zhou L, Li-Ling J, Huang H, Ma F*, Li Q. Phylogenetic analysis of vertebrate kininogen genes. Genomics, 2008, 91(2):129-141.
18. Tan S, Guo J, Huang Q, Chen X, Li-Ling J, Li Q, Ma F*. Retained introns increase putative microRNA targets within 3＇UTRs of human mRNA. FEBS Letters, 2007, 581(6):1081~1086.
19. Zhuang Y, Ma F*, Li-Ling J, Xu X, Li Y. Comparative analysis of amino acids usage and protein length distribution of alternatively and non-alternatively spliced genes across the six eukaryotic genomes. Molecular Biology and Evolution, 2003,20(12):1978~1985.
